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影響PCR特異性的因素分析

日期:2025-04-30 17:09
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摘要: 有許多因素可以影響PCR的特異性,在此我們作一歸納,供大家參考: 1、退火步驟的嚴(yán)格性:提高退火溫度可以減少不匹配的雜交,從而提高特異性。 2、減短退火時(shí)間及延伸時(shí)間可以減少錯(cuò)誤引發(fā)及錯(cuò)誤延伸。 3、引物二聚體是常見(jiàn)的副產(chǎn)品,降低引物及酶的濃度也可以減少錯(cuò)誤引發(fā),尤其是引物的二聚化。 4、改變MgCl2(有時(shí)KCl)濃度可以改進(jìn)特異性,這可能是提高反應(yīng)嚴(yán)格性或者對(duì)Taq酶的直接作用。 5、模板中如果存在次級(jí)結(jié)構(gòu),例如待擴(kuò)增的片段易自行形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)時(shí),可在PCR混合物中的4×dNTPs中加...

有許多因素可以影響PCR的特異性,在此我們作一歸納,供大家參考:

1、退火步驟的嚴(yán)格性:提高退火溫度可以減少不匹配的雜交,從而提高特異性。

2、減短退火時(shí)間及延伸時(shí)間可以減少錯(cuò)誤引發(fā)及錯(cuò)誤延伸。

3、引物二聚體是常見(jiàn)的副產(chǎn)品,降低引物及酶的濃度也可以減少錯(cuò)誤引發(fā),尤其是引物的二聚化。

4、改變MgCl2(有時(shí)KCl)濃度可以改進(jìn)特異性,這可能是提高反應(yīng)嚴(yán)格性或者對(duì)Taq酶的直接作用。

5、模板中如果存在次級(jí)結(jié)構(gòu),例如待擴(kuò)增的片段易自行形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)時(shí),可在PCR混合物中的4×dNTPs中加入7-脫氮-2’-脫氧鳥(niǎo)苷-5’-三磷酸(7-deaza-2’-deoxyguanosine-5’-trihosphate)(de7GTP)。用de7GTP與dGTP比例為3:1的混合物(150μmol/l de7GTP +50μmol/L dGTP)代替200μmol/l dGTP,則可阻非特異性產(chǎn)物的生成。